基本的に船釣りは乗り合い船であればトイレ(小)がついているのでそこで用を足します。不安であれば事前に船宿に確認すれば教えてもらえます。小型ボートなどでついていない場合は行きたくなったら一旦陸まで帰ります。また対策としては大は船に乗る前に済ませる、水分を摂りすぎないようにするなどです。但し夏場など水分を取らないと死んでしまうので気をつけてください。